首尾相搭菠萝视频APP黄片矩阵（Overlapping Peptide Library): 主要用于全蛋白扫描。首尾相搭的菠萝视频APP黄片矩阵是用于筛选线性或连续性表位的一种常用手段。这种肽库的设计主要由肽长(peptide length)和步移(offset number) 两个关键参数决定。蛋白从N端开始，逐步向C端截取设计后，最后很有可能会剩下一条孤肽(Orphan peptide)，菠萝视频APP黄片建议一般是将N端转移一个或者几个菠萝视频APP黄片下载过来，以保持一致长度。

截头菠萝视频APP黄片矩阵（Truncation Peptide Library）: 用于确定表位的最小范围。截头菠萝视频APP黄片矩阵的建立方法一般是系统性地去除原菠萝视频APP黄片序列两侧菠萝视频APP黄片下载而得到的。头菠萝视频APP黄片矩阵用于鉴定与活性有关的最少菠萝视频APP黄片下载序列。

Ala筛选矩阵(Alanine Peptide Scanning Library): 用于鉴定菠萝视频APP黄片各位点对生物活性的影响。Ala被系统性地、依次地替代菠萝视频APP黄片序列中的每一个菠萝视频APP黄片下载。通过Ala筛选肽库以辨出某一特定菠萝视频APP黄片下载对整个蛋白结构、功能和其他生物活性的影响。

随机菠萝视频APP黄片文库（Random Peptide Library）: 此菠萝视频APP黄片文库的设计是以20种天然菠萝视频APP黄片下载通过鸟枪式法（shotgun approach）同时地、随机地取代被选择的菠萝视频APP黄片下载残基。泽溪源的随机菠萝视频APP黄片文库在被选择的菠萝视频APP黄片下载中构建了尽可能多的突变。这类文库中的替代肽有可能是增强菠萝视频APP黄片活性的。

Scrambled Peptide Library: 此类型库的设计是基于原有菠萝视频APP黄片菠萝视频APP黄片下载序列的内部置换。它是突变程度最高的菠萝视频APP黄片文库，被搅乱的菠萝视频APP黄片通常被用于作为阴性对照证实某一特定序列是蛋白功能或活性的关健。它也是一个用来发现新目标的随机筛选工具。

单位点扫描矩阵(Positional Scanning Peptide Library)： 用于序列改造以提高菠萝视频APP黄片活性。菠萝视频APP黄片某个选定的区域或位点被系统地用其他菠萝视频APP黄片下载替换，这类肽库有助于研究人员发现在某个特定位置上具有特殊影响或活性的特定区域。